測量基礎體溫的方法雖然簡單，但要求嚴格，還需要長期堅持。測量前要準備一支體溫計和一張記錄基礎體溫的記錄單（如沒有這種記錄單，也可用一張小方格紙代替），從月經期開始，于每日凌晨起床前，在不說話和不作任何活動的情況下，把體溫計放在口腔里5分鐘，然后把測量到的體溫度數記錄在體溫記錄單上。
為了提高測量基礎體溫的正確性，應在每晚臨睡前把體溫計上的水銀柱甩到35℃以下，并把它放在床頭柜上或枕頭邊，以便使用時隨手可取，盡量減少活動。如果起床拿體溫計，就會使基礎體溫升高，使這一天的體溫數值失去意義。對于做中班或夜班的女性，把測量基礎體溫的時間放在每次睡覺4-6小時初醒的時候。
基礎體溫一般需要連續測量3個以上月經周期才能說明問題。如果月經周期規則的話，測量了幾個月經周期的基礎體溫后，基本上知道了自已的排卵日期。為了減少麻煩，可以選定從排卵日前的3-4天開始測試體溫，待體溫升高后再繼續測試3-4天就行了。
